华硕服务器打造生命科学研究高效计算平台

2009-12-25 13:46  出处:PConline原创  作者:佚名   责任编辑:yangshuang 

 

  高校科研作为科学研究的重要组成部分,一直以来都是我国科技创新的前沿阵地和人才培养基地。高校不仅承担着重要项目的研究工作,还担负着储蓄后备力量的重要职责。近年来,随着教育信息化的高速普及,各大院校开始大规模引入现代计算设备以提升科研效率、加快技术成果的转化进程。

  近日,在国内某知名高校生命科学学院实验室集群运算平台招标项目中,由华硕RS161-E5/PA2和华硕RS520-E6/RS8两款服务器为核心组建的高性能计算平台,从众多方案中脱颖而出,赢得了实验室项目组成员的一致认可,为高校搭建集群式高性能计算平台探索出了一条全新的思路。

需求分析 

  此次招标的高校实验室属国家重点实验室,是我国生命科学重要的研究基地,担着数十个国家级重点科研项目。在方案的前期招标过程中,实验室项目组针对新平台提出了以下几点要求:第一,由于新科研项目正在不断增加,因此提高系统的计算能力是该实验室要解决的首要问题;第二,目前实验室所承担的很多科研课题都需要建立庞大的数据库,这就要求新平台能够提供网络化存储以及核心数据的备份功能;第三,新的高性能集群运算平台需要适应不断扩张的应用需求。
 此外,由于机群经常需要全天24小时运转,为了最大限度地降低成本,项目组成员还希望该平台能够在节能方面有出色表现。

方案描述 

  通过全方位考察和反复研究,该实验室最终决定采用华硕RS161-E5/PA2和RS520-E6/RS8作为核心硬件构建应用平台。在实施过程中,RS161-E5/PA2服务器机群与多台实验室原有服务器通过高速计算网络连接到一起,实现协同并行计算;同时,华硕工程师采用一台华硕RS520-E6/RS8作为网络存储节点,用于存储和备份科研项目的海量数据;此外,借助网页式管理软件ASWM2.0,用户可以方便地进行远程监控和日常管理。

华硕

网络拓扑图:
 
  作为方案的核心计算设备,华硕RS161-E5/PA2是首款通过认证支持AMD DDPM技术(split power)与 “Dual-Link”技术的服务器,该产品采用nVIDIA nForce Professional 2200 芯片组,支持双路四核AMD Opteron 处理器。RS161-E5/PA2充分利用了双重动态电源管理(Dual Dynamic Power Management)的特性,可为处理器和内存控制器分别单独供电,带来更强大的性能和更优的电源管理能力;此外,得益于"Dual Link"技术的运用,使得服务器能消除某些应用和工作在传统前端总线架构下运行所遇到的瓶颈,尤其适合于组建HPC、GRID\database等集群等高性能计算领域应用。

  在扩展方面,华硕RS161-E5/PA2配备16个内存插槽,最多可为系统提供 64GB内存支持,满足系统在高负荷计算环境下对内存的极端需求;该机型搭载4个SATA II接口,可配置为RAID 0、RAID 1、RAID 1+0、RAID5或JBOD等多种模式;而在网络方面,华硕RS161-E5/PA2所配备的两个服务器级别的PCI-Express GbE LAN,更堪称为最专业的服务器网络连接解决方案,为集群计算节点之间的不间断数据传输提供了保障。

  同时,在方案中承担存储应用的华硕RS520-E6/RS8是华硕新近推出的一款2U高存储服务器产品。该产品不仅支持最新的至强5500系列处理器和最高可达96GB的高效能DDR3内存,更内置了多达 8组支持SAS/SATA热插拔硬盘的3.5英寸硬盘位,并能通过可选的华硕PIKE套件实现灵活的RAID阵列组合,提供应需而变的存储解决方案;服务器还集成华硕独家的EPU节能引擎,大大降低了运行功耗。

实施效果

  该集群计算平台建成后运行稳定,计算速度大幅提高,科研数据安全等级全面提升。作为平台的核心设备,华硕RS161-E5/PA2以及RS520-E6/RS8两款服务器产品在系统运行中表现出色,至今没有出现过宕机现象,为整个平台的高效稳定运行提供了坚实保障,受到了实验室各科研课题组的一致肯定。

  “该服务器机群建成后,整个系统的作业速度得到了较大的提高,从而使科研项目的周期明显缩短,达到了实验室平台升级的预期要求。”该项目组负责人表示,“此外,华硕服务器在节能方面的表现大大优于以前的设备,很好地降低了运行成本。”

 

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