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　　测试方案1对比的是NF5588分别搭载Tesla C2050与Tesla C1060时的性能对比情况，对应Tesla C2050 GPU安装了cuda3.1版本驱动，Tesla C1060 GPU安装了cuda2.3版本及cuda3.1版本驱动，都分别对同样的算例进行了测试，测试平台配置信息及测试结果分别如下。

　　上表中的测试时间均为记录系统运行算例的Wall Clock Time，由上表的数据分析可得出以下结论：

1. 驱动版本对性能的影响

　　对于相同的软件版本在不同驱动版本情况下的测试时间可知，在NF5588平台上安装cuda2.3驱动较cuda3.1的驱动对于C1060 GPU更适合（如下表），这是因为cuda2.3驱动是在Tesla 10系列的cuda架构下开发的；而Tesla 20系列的“Fermi”架构GPU，则需要 cuda3.1的驱动支持，不存在驱动版本的影响。

2. 软件版本对性能的影响

　　对比不同版本软件运行时间可知，更高版本的软件性能更优，这也是软件逐步优化版本更替的结果。如下表中的提取数据，说明NF5588在搭载C1060时NAMD_2.7b3的运行时间较NAMD_2.7b2减少25%—30%；在搭载C2050时NAMD_2.7b3的运行时间较NAMD_2.7b2减少38%—43%。

3. 多GPU加速比的分析

　　如下表，不难看出NF5588对于搭载多GPU的情况下，加速比值都不错。

4. 搭载C2050与C1060的性能对比

　　分别取两个版本NAMD软件在GPU卡适合的驱动（C1060取2.3driver；C2050取3.1driver）下得到对比图表，及性能对比数据：

　　从测试结果来看， NF5588搭载C2050对比搭载C1060，都有不同程度的提升，最好时能高出35%。但是受软件版本及GPU运行数目的影响，性能提升略有不同。如受软件版本影响，对于2.7b3版本的NAMD_CUDA软件，在C2050对比C1060上的运行性能提升更高，说明新版本软件对C2050新架构的支持更好。